AquaAmp®
Fish BOL Freshwater PCR Kit
AquaAmp®Fish BOL Freshwater PCR Kit
AquaAmp® Fish BOL Freshwater PCR Kit ได้รับการพัฒนาโดยใช้เทคโนโลยีที่จดสิทธิบัตรของบริษัทAquaGenTech Co., Ltd. (ทะเบียนเลขที่ 10-1955124,สำนักงานทรัพย์สินทางปัญญาของประเทศเกาหลี) ชุดตรวจสอบประกอบด้วยรีเอเจนต์ทั้งหมดของการทำ PCR สำหรับบาร์โค้ดดีเอ็นเอ(DNA barcoding)ของปลาทะเล(เช่น ไพรเมอร์, เอนไซม์ DNA polymerase, dNTP,บัฟเฟอร์ ฯลฯ) ดังนั้นสำหรับการวิเคราะห์โดยใช้ชุดทดสอบนี้จึงเตรียมเฉพาะจีโนม DNA ของตัวอย่างเท่านั้น
ชุดไพรเมอร์ PCR ประกอบด้วยไพรเมอร์ที่มีลำดับเบสเข้าคู่กับยีน cytochrome c oxidase 1 (CO1)ในไมโทคอนเดรียจับที่ปลายทั้งสองด้านแบบไปข้างหน้าและย้อนกลับซึ่งเป็นขอบเขตมาตรฐานของบาร์โค้ด DNA สำหรับสัตว์ ชุดไพรเมอร์ หลอมละลายบริเวณ tRNA-Tyr และ tRNA-Ser ที่อยู่ต้นสายและปลายสายของยีน CO1 ตามลำดับ และสร้างแถบ PCR เดี่ยวที่มีขนาดแอมพลิคอนประมาณ1,500 bp หลังจากการการทำPCR แบบธรรมดา ไพรเมอร์ได้รับการออกแบบมาเพื่อให้สามารถใช้ได้กับปลาน้ำจืดเกือบทุกชนิด ซึ่งช่วยให้นักวิจัยสามารจถผลิตแถบ PCR เดี่ยวที่ชัดเจนและมีอัตราความสำเร็จที่สูงกว่าที่ออกแบบโดยบริษัท Ivanova et al.(2007). ชุดอุปกรณ์นี้สามารถนำไปใช้กับบาร์โค้ด DNA ของปลาที่ยังมีชีวิต (ไข่ เนื้อเยื่อตัวอ่อนและตัวเต็มวัย) และตัวอย่างอาหารแปรรูปได้อย่างง่ายดาย นอกจากนี้นักวิจัยได้ทำการจัดลำดับ DNAที่สะดวกต่อการใช้งานโดยใช้อะแดปเตอร์เฉพาะที่ติดอยู่กับขั้ว 5′ ของไพรเมอร์ทั้งแบบเดินหน้าและถอยหลัง
특징 및 장점
ประสิทธิภาพของ AquaAmp® Fish BOL Freshwater PCR Kit ได้รับการตรวจสอบโดยใช้ตัวอย่างปลาน้ำจืดที่ยังมีชีวิต 21 ตัวอย่างที่อยู่ในกลุ่มอนุกรมวิธานที่หลากหลาย (เช่น Perciformes, Beloniformes, Synbranchiformes, Siluriformes, Osmeriformes, Mugiliformes, Scorpaeniformes, Cypriniformes และ Gasterosteiformes) ซึ่งตัวอย่างทั้งหมดสามารถผลิตแถบ PCR เดี่ยวที่ชัดเจนพร้อมกับได้ขนาดแอมพลิคอนที่คาดไว้